Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG7

DENND6B, Protein DENND6B, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND6BQ8NEG7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND6BQ8NEG7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND6BQ8NEG7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND6BQ8NEG7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND6BQ8NEG7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND6BQ8NEG7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND6BQ8NEG7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND6BQ8NEG7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND6BQ8NEG7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND6BQ8NEG7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND6BQ8NEG7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND6BQ8NEG7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND6BQ8NEG7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND6BQ8NEG7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND6BQ8NEG7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND6BQ8NEG7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms