Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf106Q8NAJ2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf106Q8NAJ2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf106Q8NAJ2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms