Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC47Q8N1G4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRC47Q8N1G4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRC47Q8N1G4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC47Q8N1G4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC47Q8N1G4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC47Q8N1G4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC47Q8N1G4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC47Q8N1G4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC47Q8N1G4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC47Q8N1G4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC47Q8N1G4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC47Q8N1G4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC47Q8N1G4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC47Q8N1G4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC47Q8N1G4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC47Q8N1G4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC47Q8N1G4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
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