Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM50Q86XT4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM50Q86XT4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM50Q86XT4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM50Q86XT4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM50Q86XT4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM50Q86XT4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM50Q86XT4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM50Q86XT4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM50Q86XT4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM50Q86XT4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM50Q86XT4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM50Q86XT4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM50Q86XT4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM50Q86XT4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM50Q86XT4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM50Q86XT4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM50Q86XT4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM50Q86XT4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM50Q86XT4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM50Q86XT4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM50Q86XT4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM50Q86XT4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM50Q86XT4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM50Q86XT4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms