Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYFIP1Q7L576 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CYFIP1Q7L576 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CYFIP1Q7L576 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYFIP1Q7L576 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms