Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSJ9

SHISA6, Protein shisa-6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA6Q6ZSJ9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA6Q6ZSJ9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA6Q6ZSJ9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHISA6Q6ZSJ9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms