Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC36A4Q6YBV0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC36A4Q6YBV0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC36A4Q6YBV0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC36A4Q6YBV0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC36A4Q6YBV0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC36A4Q6YBV0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms