Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3E5

GDPD4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD4Q6W3E5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDPD4Q6W3E5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDPD4Q6W3E5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDPD4Q6W3E5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDPD4Q6W3E5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDPD4Q6W3E5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDPD4Q6W3E5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDPD4Q6W3E5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDPD4Q6W3E5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDPD4Q6W3E5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDPD4Q6W3E5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDPD4Q6W3E5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDPD4Q6W3E5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDPD4Q6W3E5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDPD4Q6W3E5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDPD4Q6W3E5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GDPD4Q6W3E5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDPD4Q6W3E5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDPD4Q6W3E5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDPD4Q6W3E5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDPD4Q6W3E5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDPD4Q6W3E5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDPD4Q6W3E5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GDPD4Q6W3E5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDPD4Q6W3E5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDPD4Q6W3E5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms