Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB35

MTHFD1L, Monofunctional C1-tetrahydrofolate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1LQ6UB35 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTHFD1LQ6UB35 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTHFD1LQ6UB35 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTHFD1LQ6UB35 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTHFD1LQ6UB35 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTHFD1LQ6UB35 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTHFD1LQ6UB35 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTHFD1LQ6UB35 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTHFD1LQ6UB35 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MTHFD1LQ6UB35 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTHFD1LQ6UB35 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTHFD1LQ6UB35 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms