Protein–RNA interactions for Protein: Q6QN14

USP17L6P, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L6PQ6QN14 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L6PQ6QN14 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L6PQ6QN14 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP17L6PQ6QN14 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L6PQ6QN14 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L6PQ6QN14 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L6PQ6QN14 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP17L6PQ6QN14 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP17L6PQ6QN14 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP17L6PQ6QN14 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP17L6PQ6QN14 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L6PQ6QN14 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L6PQ6QN14 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L6PQ6QN14 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L6PQ6QN14 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L6PQ6QN14 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L6PQ6QN14 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L6PQ6QN14 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L6PQ6QN14 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L6PQ6QN14 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L6PQ6QN14 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L6PQ6QN14 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L6PQ6QN14 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L6PQ6QN14 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L6PQ6QN14 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L6PQ6QN14 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L6PQ6QN14 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L6PQ6QN14 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L6PQ6QN14 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L6PQ6QN14 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
USP17L6PQ6QN14 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
USP17L6PQ6QN14 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L6PQ6QN14 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L6PQ6QN14 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L6PQ6QN14 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.57■■■□□ 2
USP17L6PQ6QN14 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L6PQ6QN14 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L6PQ6QN14 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms