Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB0

VWA1, von Willebrand factor A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA1Q6PCB0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA1Q6PCB0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA1Q6PCB0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VWA1Q6PCB0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VWA1Q6PCB0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VWA1Q6PCB0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VWA1Q6PCB0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VWA1Q6PCB0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA1Q6PCB0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA1Q6PCB0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA1Q6PCB0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA1Q6PCB0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA1Q6PCB0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA1Q6PCB0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA1Q6PCB0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA1Q6PCB0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA1Q6PCB0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms