Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT80Q6KB66 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT80Q6KB66 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT80Q6KB66 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms