Protein–RNA interactions for Protein: Q5W5X9

TTC23, Tetratricopeptide repeat protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC23Q5W5X9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC23Q5W5X9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms