Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM46CQ5VWP2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM46CQ5VWP2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM46CQ5VWP2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM46CQ5VWP2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM46CQ5VWP2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM46CQ5VWP2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms