Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU57

AGBL4, Cytosolic carboxypeptidase 6, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL4Q5VU57 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGBL4Q5VU57 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AGBL4Q5VU57 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGBL4Q5VU57 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGBL4Q5VU57 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGBL4Q5VU57 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGBL4Q5VU57 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AGBL4Q5VU57 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGBL4Q5VU57 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGBL4Q5VU57 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGBL4Q5VU57 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGBL4Q5VU57 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AGBL4Q5VU57 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGBL4Q5VU57 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGBL4Q5VU57 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGBL4Q5VU57 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGBL4Q5VU57 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGBL4Q5VU57 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGBL4Q5VU57 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGBL4Q5VU57 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGBL4Q5VU57 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGBL4Q5VU57 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGBL4Q5VU57 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AGBL4Q5VU57 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGBL4Q5VU57 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGBL4Q5VU57 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
AGBL4Q5VU57 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGBL4Q5VU57 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGBL4Q5VU57 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGBL4Q5VU57 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGBL4Q5VU57 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGBL4Q5VU57 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGBL4Q5VU57 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGBL4Q5VU57 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AGBL4Q5VU57 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGBL4Q5VU57 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGBL4Q5VU57 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGBL4Q5VU57 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGBL4Q5VU57 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms