Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF17Q5VTA0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF17Q5VTA0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF17Q5VTA0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms