Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPO2Q5TGU0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPO2Q5TGU0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSPO2Q5TGU0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms