Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRAP1Q5SW96 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDLRAP1Q5SW96 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LDLRAP1Q5SW96 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms