Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ68

SPDYC, Speedy protein C, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYCQ5MJ68 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPDYCQ5MJ68 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPDYCQ5MJ68 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPDYCQ5MJ68 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPDYCQ5MJ68 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPDYCQ5MJ68 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPDYCQ5MJ68 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPDYCQ5MJ68 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPDYCQ5MJ68 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPDYCQ5MJ68 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPDYCQ5MJ68 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SPDYCQ5MJ68 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPDYCQ5MJ68 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPDYCQ5MJ68 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPDYCQ5MJ68 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPDYCQ5MJ68 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYCQ5MJ68 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYCQ5MJ68 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYCQ5MJ68 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYCQ5MJ68 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYCQ5MJ68 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYCQ5MJ68 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYCQ5MJ68 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYCQ5MJ68 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYCQ5MJ68 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYCQ5MJ68 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYCQ5MJ68 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYCQ5MJ68 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYCQ5MJ68 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYCQ5MJ68 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYCQ5MJ68 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYCQ5MJ68 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYCQ5MJ68 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYCQ5MJ68 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYCQ5MJ68 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYCQ5MJ68 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYCQ5MJ68 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms