Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
FOXD1Q16676 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
FOXD1Q16676 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
FOXD1Q16676 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
FOXD1Q16676 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
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