Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 BAG6-236ENST00000375964 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.893e-17■■■■□ 20.7
SRSF7Q16629 BAG6-237ENST00000375976 3644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.893e-17■■■■□ 20.7
SRSF7Q16629 BAG6-239ENST00000424176 747 ntTSL 39.19□□□□□ -0.943e-17■■■■□ 20.7
SRSF7Q16629 PLCB1-213ENST00000626114 598 ntTSL 58.04□□□□□ -1.128e-7■■■■□ 20.7
SRSF7Q16629 PLCB1-227ENST00000636825 3020 ntTSL 56.75□□□□□ -1.338e-7■■■■□ 20.7
SRSF7Q16629 PLCB1-221ENST00000635830 3237 ntTSL 56.14□□□□□ -1.438e-7■■■■□ 20.7
SRSF7Q16629 PLCB1-226ENST00000636784 100 ntTSL 53□□□□□ -1.938e-7■■■■□ 20.7
SRSF7Q16629 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.753e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 SCARB1-206ENST00000539320 720 ntTSL 217.15■□□□□ 0.343e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.293e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 PAPOLA-205ENST00000553689 2267 ntTSL 1 (best)16.52■□□□□ 0.233e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.233e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 SCARB1-210ENST00000545493 581 ntTSL 216.27■□□□□ 0.23e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.191e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.183e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 MAX-215ENST00000556892 474 ntTSL 515.59■□□□□ 0.091e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.063e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.043e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 TPM3-220ENST00000509601 543 ntTSL 413.92□□□□□ -0.183e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 SCARB1-205ENST00000538291 5527 ntTSL 513.87□□□□□ -0.193e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.223e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.243e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.263e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.293e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.311e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.363e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.383e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.381e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.413e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.423e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.421e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.461e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.483e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 AP2M1-215ENST00000468048 1172 ntTSL 1 (best)11.97□□□□□ -0.493e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.53e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 TPM3-219ENST00000509409 1248 ntTSL 211.85□□□□□ -0.513e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 ACTR2-203ENST00000471552 554 ntTSL 411.85□□□□□ -0.513e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.521e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.533e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.533e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 AP2M1-212ENST00000461733 1470 ntTSL 211.69□□□□□ -0.543e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.563e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.571e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 TFR2-206ENST00000465294 2763 ntTSL 211.46□□□□□ -0.573e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.583e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.583e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.583e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.593e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 AP2M1-216ENST00000472560 910 ntTSL 211.31□□□□□ -0.63e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.63e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.611e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 MAX-206ENST00000394606 2097 ntTSL 1 (best)11□□□□□ -0.651e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 ROR2-205ENST00000495386 664 ntTSL 310.92□□□□□ -0.663e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 TPM3-216ENST00000473036 746 ntTSL 210.56□□□□□ -0.723e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.733e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 ROR2-206ENST00000546883 501 ntTSL 310.45□□□□□ -0.743e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 ACTR2-204ENST00000476840 587 ntTSL 410.3□□□□□ -0.763e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 MAX-216ENST00000556979 615 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.781e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 MAX-214ENST00000556702 520 ntTSL 210.2□□□□□ -0.781e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 SCARB1-204ENST00000535005 1845 ntTSL 1 (best)10.14□□□□□ -0.793e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 TPM3-223ENST00000611659 3149 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.793e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 SCARB1-207ENST00000541661 476 ntTSL 510.06□□□□□ -0.83e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 ROR2-201ENST00000375708 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.873e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.893e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 MAX-209ENST00000554709 327 ntTSL 49.49□□□□□ -0.891e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 MAX-202ENST00000284165 3155 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.951e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 AP2M1-206ENST00000432591 802 ntTSL 59.04□□□□□ -0.963e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 TPM3-209ENST00000368527 569 ntTSL 48.93□□□□□ -0.983e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 SMC3-201ENST00000361804 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.993e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 TPM3-212ENST00000368533 3131 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -13e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 AP2M1-222ENST00000621863 1305 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -13e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 TPM3-210ENST00000368530 1523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.093e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 MAX-213ENST00000556443 585 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.11e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 TPM3-207ENST00000341372 2007 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.13e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 PAPOLA-216ENST00000555701 1875 ntTSL 27.98□□□□□ -1.133e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.173e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 ACTR2-201ENST00000260641 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.183e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 AP2M1-221ENST00000490151 570 ntTSL 57.09□□□□□ -1.273e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 TPM3-201ENST00000271850 1219 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.313e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 TPM3-215ENST00000469717 4041 ntTSL 26.6□□□□□ -1.353e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 TPM3-203ENST00000312970 750 ntTSL 56.24□□□□□ -1.413e-11■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 PAPOLA-222ENST00000556787 806 ntTSL 25.75□□□□□ -1.493e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 RPS6KC1-203ENST00000468069 784 ntTSL 35.4□□□□□ -1.543e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 PAPOLA-209ENST00000554666 558 ntTSL 25.07□□□□□ -1.63e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.893e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 RPS6KC1-204ENST00000490299 5154 ntTSL 1 (best)3.2□□□□□ -1.93e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 PAPOLA-215ENST00000555626 2272 ntTSL 1 (best)3.07□□□□□ -1.923e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.012e-6■■■■□ 20.4
SRSF7Q16629 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.462e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 PRC1-201ENST00000361188 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.92e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 PRC1-206ENST00000555455 830 ntTSL 39.39□□□□□ -0.912e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 PRC1-202ENST00000394249 3034 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 PRC1-214ENST00000559326 476 ntTSL 38.28□□□□□ -1.082e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 PRC1-216ENST00000559828 584 ntTSL 38.14□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 PRC1-219ENST00000560914 673 ntTSL 25.3□□□□□ -1.562e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.743e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.613e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SPATS2L-221ENST00000459656 1901 ntTSL 1 (best)17.32■□□□□ 0.363e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.363e-6■■■■□ 20.3
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