RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468048.5

AP2M1-215, Transcript of adaptor related protein complex 2 subunit mu 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene AP2M1, Length 1,172 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2M1-215ENST00000468048 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.24■■■■□ 3.87
AP2M1-215ENST00000468048 ABCC9O60706 1549 aa35.18■■■■□ 3.22
AP2M1-215ENST00000468048 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.99■■■■□ 3.19
AP2M1-215ENST00000468048 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.35■■■□□ 2.93
AP2M1-215ENST00000468048 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.23■■■□□ 2.91
AP2M1-215ENST00000468048 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.21■■■□□ 2.91
AP2M1-215ENST00000468048 NACADO15069 1562 aa33.17■■■□□ 2.9
AP2M1-215ENST00000468048 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.9■■■□□ 2.86
AP2M1-215ENST00000468048 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.73■■■□□ 2.83
AP2M1-215ENST00000468048 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.6■■■□□ 2.81
AP2M1-215ENST00000468048 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.52■■■□□ 2.8
AP2M1-215ENST00000468048 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
AP2M1-215ENST00000468048 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.35■■■□□ 2.77
AP2M1-215ENST00000468048 SCRIBQ14160 1630 aa32■■■□□ 2.71
AP2M1-215ENST00000468048 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.88■■■□□ 2.69
AP2M1-215ENST00000468048 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.71■■■□□ 2.67
AP2M1-215ENST00000468048 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.65■■■□□ 2.66
AP2M1-215ENST00000468048 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
AP2M1-215ENST00000468048 NCAPD3P42695 1498 aa30.73■■■□□ 2.51
AP2M1-215ENST00000468048 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.65■■■□□ 2.5
AP2M1-215ENST00000468048 SMARCA4P51532 1647 aa30.53■■■□□ 2.48
AP2M1-215ENST00000468048 SMARCA2P51531 1590 aa30.42■■■□□ 2.46
AP2M1-215ENST00000468048 HMGXB3Q12766 1538 aa30.37■■■□□ 2.45
AP2M1-215ENST00000468048 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
AP2M1-215ENST00000468048 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.31■■■□□ 2.44
AP2M1-215ENST00000468048 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.29■■■□□ 2.44
AP2M1-215ENST00000468048 NESP48681 1621 aa30.28■■■□□ 2.44
AP2M1-215ENST00000468048 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.44
AP2M1-215ENST00000468048 ERCC6Q03468 1493 aa30.25■■■□□ 2.43
AP2M1-215ENST00000468048 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.24■■■□□ 2.43
AP2M1-215ENST00000468048 CUX2O14529 1486 aa30.18■■■□□ 2.42
AP2M1-215ENST00000468048 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.9■■■□□ 2.38
AP2M1-215ENST00000468048 WIZO95785 1651 aa29.87■■■□□ 2.37
AP2M1-215ENST00000468048 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.82■■■□□ 2.36
AP2M1-215ENST00000468048 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
AP2M1-215ENST00000468048 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.79■■■□□ 2.36
AP2M1-215ENST00000468048 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
AP2M1-215ENST00000468048 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.71■■■□□ 2.35
AP2M1-215ENST00000468048 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.51■■■□□ 2.31
AP2M1-215ENST00000468048 CFTRP13569 1480 aa29.46■■■□□ 2.31
AP2M1-215ENST00000468048 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
AP2M1-215ENST00000468048 WDR62O43379 1518 aa29.43■■■□□ 2.3
AP2M1-215ENST00000468048 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.42■■■□□ 2.3
AP2M1-215ENST00000468048 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.38■■■□□ 2.29
AP2M1-215ENST00000468048 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.24■■■□□ 2.27
AP2M1-215ENST00000468048 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
AP2M1-215ENST00000468048 TRIM41Q8WV44 630 aa28.97■■■□□ 2.23
AP2M1-215ENST00000468048 OSCARQ8IYS5 282 aa28.95■■■□□ 2.22
AP2M1-215ENST00000468048 PRDM2Q13029 1718 aa28.9■■■□□ 2.22
AP2M1-215ENST00000468048 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.21
AP2M1-215ENST00000468048 TOPBP1Q92547 1522 aa28.88■■■□□ 2.21
AP2M1-215ENST00000468048 IFT140Q96RY7 1462 aa28.82■■■□□ 2.2
AP2M1-215ENST00000468048 ABCC8Q09428 1581 aa28.72■■■□□ 2.19
AP2M1-215ENST00000468048 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.7■■■□□ 2.18
AP2M1-215ENST00000468048 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.66■■■□□ 2.189e-7■■■■■ 52.5
AP2M1-215ENST00000468048 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
AP2M1-215ENST00000468048 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
AP2M1-215ENST00000468048 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.57■■■□□ 2.16
AP2M1-215ENST00000468048 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
AP2M1-215ENST00000468048 SOGA1O94964 1423 aa28.51■■■□□ 2.15
AP2M1-215ENST00000468048 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
AP2M1-215ENST00000468048 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
AP2M1-215ENST00000468048 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.46■■■□□ 2.15
AP2M1-215ENST00000468048 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.46■■■□□ 2.15
AP2M1-215ENST00000468048 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.46■■■□□ 2.15
AP2M1-215ENST00000468048 FBLN2P98095 1184 aa28.43■■■□□ 2.14
AP2M1-215ENST00000468048 CUX1P39880 1505 aa28.43■■■□□ 2.14
AP2M1-215ENST00000468048 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.41■■■□□ 2.14
AP2M1-215ENST00000468048 ARHGEF11O15085 1522 aa28.4■■■□□ 2.14
AP2M1-215ENST00000468048 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.32■■■□□ 2.12
AP2M1-215ENST00000468048 CHD1O14646 1710 aa28.32■■■□□ 2.12
AP2M1-215ENST00000468048 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.26■■■□□ 2.11
AP2M1-215ENST00000468048 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
AP2M1-215ENST00000468048 GRIN2BQ13224 1484 aa28.17■■■□□ 2.1
AP2M1-215ENST00000468048 ARAP1Q96P48 1450 aa28.16■■■□□ 2.1
AP2M1-215ENST00000468048 WDR97A6NE52 1622 aa28.14■■■□□ 2.1
AP2M1-215ENST00000468048 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
AP2M1-215ENST00000468048 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.11■■■□□ 2.09
AP2M1-215ENST00000468048 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.08■■■□□ 2.09
AP2M1-215ENST00000468048 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.08■■■□□ 2.09
AP2M1-215ENST00000468048 SYNJ2O15056 1496 aa28.07■■■□□ 2.08
AP2M1-215ENST00000468048 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.98■■■□□ 2.07
AP2M1-215ENST00000468048 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.98■■■□□ 2.07
AP2M1-215ENST00000468048 SYNJ1O43426 1573 aa27.97■■■□□ 2.07
AP2M1-215ENST00000468048 PBRM1Q86U86 1689 aa27.94■■■□□ 2.06
AP2M1-215ENST00000468048 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
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AP2M1-215ENST00000468048 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.86■■■□□ 2.05
AP2M1-215ENST00000468048 GRIN2AQ12879 1464 aa27.82■■■□□ 2.04
AP2M1-215ENST00000468048 NUP160Q12769 1436 aa27.75■■■□□ 2.03
AP2M1-215ENST00000468048 ADAMTS12P58397 1594 aa27.75■■■□□ 2.03
AP2M1-215ENST00000468048 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.75■■■□□ 2.03
AP2M1-215ENST00000468048 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.75■■■□□ 2.03
AP2M1-215ENST00000468048 CEP170Q5SW79 1584 aa27.73■■■□□ 2.03
AP2M1-215ENST00000468048 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.67■■■□□ 2.02
AP2M1-215ENST00000468048 JPH4Q96JJ6 628 aa27.57■■■□□ 2
AP2M1-215ENST00000468048 SHROOM2Q13796 1616 aa27.55■■■□□ 2
AP2M1-215ENST00000468048 IGF1RP08069 1367 aa27.53■■■□□ 2
AP2M1-215ENST00000468048 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
AP2M1-215ENST00000468048 KIF27Q86VH2 1401 aa27.38■■□□□ 1.97
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