RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472560.5

AP2M1-216, Transcript of adaptor related protein complex 2 subunit mu 1, humanhuman

TSL 2

Gene AP2M1, Length 910 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2M1-216ENST00000472560 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.92■■■■□ 3.34
AP2M1-216ENST00000472560 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.05■■■□□ 2.72
AP2M1-216ENST00000472560 ABCC9O60706 1549 aa31.84■■■□□ 2.69
AP2M1-216ENST00000472560 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.41■■■□□ 2.46
AP2M1-216ENST00000472560 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.31■■■□□ 2.44
AP2M1-216ENST00000472560 NACADO15069 1562 aa30.28■■■□□ 2.44
AP2M1-216ENST00000472560 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.94■■■□□ 2.38
AP2M1-216ENST00000472560 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
AP2M1-216ENST00000472560 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.72■■■□□ 2.35
AP2M1-216ENST00000472560 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.66■■■□□ 2.34
AP2M1-216ENST00000472560 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.64■■■□□ 2.34
AP2M1-216ENST00000472560 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.63■■■□□ 2.33
AP2M1-216ENST00000472560 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.47■■■□□ 2.31
AP2M1-216ENST00000472560 SCRIBQ14160 1630 aa29.27■■■□□ 2.28
AP2M1-216ENST00000472560 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.13■■■□□ 2.25
AP2M1-216ENST00000472560 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
AP2M1-216ENST00000472560 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.74■■■□□ 2.19
AP2M1-216ENST00000472560 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.65■■■□□ 2.18
AP2M1-216ENST00000472560 NCAPD3P42695 1498 aa27.95■■■□□ 2.07
AP2M1-216ENST00000472560 SMARCA4P51532 1647 aa27.94■■■□□ 2.06
AP2M1-216ENST00000472560 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.91■■■□□ 2.06
AP2M1-216ENST00000472560 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.89■■■□□ 2.06
AP2M1-216ENST00000472560 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
AP2M1-216ENST00000472560 SMARCA2P51531 1590 aa27.85■■■□□ 2.05
AP2M1-216ENST00000472560 HMGXB3Q12766 1538 aa27.75■■■□□ 2.03
AP2M1-216ENST00000472560 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
AP2M1-216ENST00000472560 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.68■■■□□ 2.02
AP2M1-216ENST00000472560 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.65■■■□□ 2.02
AP2M1-216ENST00000472560 ERCC6Q03468 1493 aa27.49■■□□□ 1.99
AP2M1-216ENST00000472560 NESP48681 1621 aa27.41■■□□□ 1.98
AP2M1-216ENST00000472560 WIZO95785 1651 aa27.35■■□□□ 1.97
AP2M1-216ENST00000472560 CUX2O14529 1486 aa27.3■■□□□ 1.96
AP2M1-216ENST00000472560 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.26■■□□□ 1.96
AP2M1-216ENST00000472560 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
AP2M1-216ENST00000472560 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.15■■□□□ 1.94
AP2M1-216ENST00000472560 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.14■■□□□ 1.94
AP2M1-216ENST00000472560 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
AP2M1-216ENST00000472560 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
AP2M1-216ENST00000472560 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.03■■□□□ 1.92
AP2M1-216ENST00000472560 CFTRP13569 1480 aa26.87■■□□□ 1.89
AP2M1-216ENST00000472560 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.87■■□□□ 1.89
AP2M1-216ENST00000472560 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.83■■□□□ 1.89
AP2M1-216ENST00000472560 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.83■■□□□ 1.89
AP2M1-216ENST00000472560 WDR62O43379 1518 aa26.76■■□□□ 1.87
AP2M1-216ENST00000472560 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.74■■□□□ 1.87
AP2M1-216ENST00000472560 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
AP2M1-216ENST00000472560 PRDM2Q13029 1718 aa26.56■■□□□ 1.84
AP2M1-216ENST00000472560 TRIM41Q8WV44 630 aa26.35■■□□□ 1.81
AP2M1-216ENST00000472560 TOPBP1Q92547 1522 aa26.34■■□□□ 1.81
AP2M1-216ENST00000472560 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
AP2M1-216ENST00000472560 ABCC8Q09428 1581 aa26.32■■□□□ 1.8
AP2M1-216ENST00000472560 IFT140Q96RY7 1462 aa26.28■■□□□ 1.8
AP2M1-216ENST00000472560 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.26■■□□□ 1.79
AP2M1-216ENST00000472560 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
AP2M1-216ENST00000472560 OSCARQ8IYS5 282 aa26.16■■□□□ 1.78
AP2M1-216ENST00000472560 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
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AP2M1-216ENST00000472560 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26■■□□□ 1.75
AP2M1-216ENST00000472560 CUX1P39880 1505 aa25.98■■□□□ 1.75
AP2M1-216ENST00000472560 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.98■■□□□ 1.75
AP2M1-216ENST00000472560 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
AP2M1-216ENST00000472560 FBLN2P98095 1184 aa25.85■■□□□ 1.73
AP2M1-216ENST00000472560 WDR97A6NE52 1622 aa25.81■■□□□ 1.72
AP2M1-216ENST00000472560 CHD1O14646 1710 aa25.77■■□□□ 1.72
AP2M1-216ENST00000472560 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.75■■□□□ 1.71
AP2M1-216ENST00000472560 GRIN2BQ13224 1484 aa25.73■■□□□ 1.71
AP2M1-216ENST00000472560 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
AP2M1-216ENST00000472560 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.7■■□□□ 1.71
AP2M1-216ENST00000472560 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.7■■□□□ 1.71
AP2M1-216ENST00000472560 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.7■■□□□ 1.71
AP2M1-216ENST00000472560 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
AP2M1-216ENST00000472560 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.69■■□□□ 1.7
AP2M1-216ENST00000472560 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.69■■□□□ 1.7
AP2M1-216ENST00000472560 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
AP2M1-216ENST00000472560 ARHGEF11O15085 1522 aa25.68■■□□□ 1.7
AP2M1-216ENST00000472560 TOP2BQ02880 1626 aa25.64■■□□□ 1.7
AP2M1-216ENST00000472560 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.63■■□□□ 1.69
AP2M1-216ENST00000472560 SYNJ1O43426 1573 aa25.62■■□□□ 1.69
AP2M1-216ENST00000472560 SYNJ2O15056 1496 aa25.6■■□□□ 1.69
AP2M1-216ENST00000472560 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.59■■□□□ 1.69
AP2M1-216ENST00000472560 PBRM1Q86U86 1689 aa25.59■■□□□ 1.69
AP2M1-216ENST00000472560 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.54■■□□□ 1.68
AP2M1-216ENST00000472560 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.5■■□□□ 1.67
AP2M1-216ENST00000472560 ARAP1Q96P48 1450 aa25.44■■□□□ 1.66
AP2M1-216ENST00000472560 GRIN2AQ12879 1464 aa25.39■■□□□ 1.65
AP2M1-216ENST00000472560 ADAMTS12P58397 1594 aa25.39■■□□□ 1.65
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AP2M1-216ENST00000472560 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.37■■□□□ 1.65
AP2M1-216ENST00000472560 NUP160Q12769 1436 aa25.29■■□□□ 1.64
AP2M1-216ENST00000472560 CEP170Q5SW79 1584 aa25.27■■□□□ 1.64
AP2M1-216ENST00000472560 KIF27Q86VH2 1401 aa25.2■■□□□ 1.63
AP2M1-216ENST00000472560 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
AP2M1-216ENST00000472560 IGF1RP08069 1367 aa25.15■■□□□ 1.62
AP2M1-216ENST00000472560 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.14■■□□□ 1.61
AP2M1-216ENST00000472560 SHROOM2Q13796 1616 aa25.1■■□□□ 1.61
AP2M1-216ENST00000472560 JPH4Q96JJ6 628 aa25.08■■□□□ 1.61
AP2M1-216ENST00000472560 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
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