Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDC37Q16543 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC37Q16543 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC37Q16543 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.4 ms