Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPE65Q16518 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPE65Q16518 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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