Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRA6Q16445 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABRA6Q16445 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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