Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCEA2Q15560 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCEA2Q15560 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms