Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDGFRLQ15198 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFRLQ15198 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFRLQ15198 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
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