Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBA3CQ13748 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBA3CQ13748 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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