Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
STRN3Q13033 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRN3Q13033 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms