Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
GOLGA3Q08378 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
GOLGA3Q08378 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
GOLGA3Q08378 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
GOLGA3Q08378 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
GOLGA3Q08378 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
GOLGA3Q08378 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
GOLGA3Q08378 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
GOLGA3Q08378 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
GOLGA3Q08378 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
GOLGA3Q08378 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
GOLGA3Q08378 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
GOLGA3Q08378 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
GOLGA3Q08378 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
GOLGA3Q08378 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
GOLGA3Q08378 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
GOLGA3Q08378 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
GOLGA3Q08378 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
GOLGA3Q08378 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
GOLGA3Q08378 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
GOLGA3Q08378 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
GOLGA3Q08378 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
GOLGA3Q08378 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
GOLGA3Q08378 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
GOLGA3Q08378 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
GOLGA3Q08378 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
GOLGA3Q08378 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
GOLGA3Q08378 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.95
GOLGA3Q08378 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
GOLGA3Q08378 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.6■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
GOLGA3Q08378 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC39.54■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC39.54■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms