Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPN12Q05209 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPN12Q05209 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms