Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT17Q04695 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms