Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SP4Q02446 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SP4Q02446 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SP4Q02446 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SP4Q02446 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SP4Q02446 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SP4Q02446 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SP4Q02446 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SP4Q02446 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SP4Q02446 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SP4Q02446 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SP4Q02446 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SP4Q02446 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SP4Q02446 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SP4Q02446 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SP4Q02446 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SP4Q02446 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SP4Q02446 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SP4Q02446 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SP4Q02446 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SP4Q02446 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SP4Q02446 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SP4Q02446 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SP4Q02446 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SP4Q02446 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SP4Q02446 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SP4Q02446 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SP4Q02446 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SP4Q02446 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SP4Q02446 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SP4Q02446 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SP4Q02446 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SP4Q02446 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SP4Q02446 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SP4Q02446 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SP4Q02446 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SP4Q02446 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SP4Q02446 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SP4Q02446 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SP4Q02446 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SP4Q02446 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SP4Q02446 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SP4Q02446 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SP4Q02446 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SP4Q02446 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SP4Q02446 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SP4Q02446 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SP4Q02446 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SP4Q02446 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SP4Q02446 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SP4Q02446 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SP4Q02446 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SP4Q02446 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SP4Q02446 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SP4Q02446 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SP4Q02446 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SP4Q02446 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SP4Q02446 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SP4Q02446 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SP4Q02446 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SP4Q02446 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SP4Q02446 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SP4Q02446 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SP4Q02446 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SP4Q02446 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SP4Q02446 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SP4Q02446 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SP4Q02446 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SP4Q02446 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SP4Q02446 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SP4Q02446 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SP4Q02446 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SP4Q02446 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SP4Q02446 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SP4Q02446 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SP4Q02446 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SP4Q02446 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SP4Q02446 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SP4Q02446 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SP4Q02446 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SP4Q02446 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SP4Q02446 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SP4Q02446 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SP4Q02446 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SP4Q02446 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SP4Q02446 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SP4Q02446 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SP4Q02446 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SP4Q02446 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SP4Q02446 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SP4Q02446 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SP4Q02446 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SP4Q02446 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SP4Q02446 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SP4Q02446 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SP4Q02446 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SP4Q02446 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SP4Q02446 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SP4Q02446 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SP4Q02446 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms