Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL7P80098 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL7P80098 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL7P80098 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL7P80098 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL7P80098 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL7P80098 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL7P80098 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL7P80098 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL7P80098 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL7P80098 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCL7P80098 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL7P80098 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL7P80098 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL7P80098 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL7P80098 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL7P80098 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL7P80098 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL7P80098 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL7P80098 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL7P80098 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL7P80098 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL7P80098 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL7P80098 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL7P80098 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL7P80098 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL7P80098 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL7P80098 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL7P80098 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL7P80098 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL7P80098 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL7P80098 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL7P80098 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL7P80098 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL7P80098 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL7P80098 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL7P80098 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL7P80098 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL7P80098 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL7P80098 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL7P80098 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL7P80098 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL7P80098 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL7P80098 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL7P80098 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL7P80098 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL7P80098 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL7P80098 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL7P80098 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL7P80098 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL7P80098 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL7P80098 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL7P80098 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL7P80098 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL7P80098 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL7P80098 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL7P80098 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL7P80098 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL7P80098 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCL7P80098 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL7P80098 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL7P80098 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL7P80098 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL7P80098 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL7P80098 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL7P80098 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL7P80098 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL7P80098 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL7P80098 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL7P80098 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL7P80098 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL7P80098 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL7P80098 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL7P80098 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL7P80098 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL7P80098 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL7P80098 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL7P80098 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL7P80098 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL7P80098 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL7P80098 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL7P80098 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL7P80098 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL7P80098 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL7P80098 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL7P80098 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL7P80098 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL7P80098 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL7P80098 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL7P80098 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL7P80098 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL7P80098 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL7P80098 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL7P80098 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL7P80098 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL7P80098 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL7P80098 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL7P80098 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL7P80098 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL7P80098 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms