Protein–RNA interactions for Protein: P61163

ACTR1A, Alpha-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1AP61163 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTR1AP61163 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTR1AP61163 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTR1AP61163 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTR1AP61163 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTR1AP61163 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTR1AP61163 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTR1AP61163 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTR1AP61163 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTR1AP61163 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTR1AP61163 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTR1AP61163 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTR1AP61163 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTR1AP61163 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTR1AP61163 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTR1AP61163 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTR1AP61163 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTR1AP61163 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACTR1AP61163 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTR1AP61163 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTR1AP61163 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms