Protein–RNA interactions for Protein: P57727

TMPRSS3, Transmembrane protease serine 3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS3P57727 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMPRSS3P57727 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS3P57727 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS3P57727 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms