Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC13P55735 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC13P55735 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC13P55735 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC13P55735 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC13P55735 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC13P55735 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEC13P55735 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEC13P55735 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SEC13P55735 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC13P55735 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC13P55735 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC13P55735 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC13P55735 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC13P55735 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC13P55735 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC13P55735 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC13P55735 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC13P55735 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC13P55735 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC13P55735 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC13P55735 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC13P55735 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC13P55735 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC13P55735 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC13P55735 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC13P55735 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC13P55735 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC13P55735 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC13P55735 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC13P55735 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC13P55735 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC13P55735 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC13P55735 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC13P55735 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC13P55735 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC13P55735 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC13P55735 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC13P55735 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC13P55735 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC13P55735 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC13P55735 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC13P55735 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC13P55735 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC13P55735 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC13P55735 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC13P55735 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC13P55735 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC13P55735 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC13P55735 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC13P55735 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC13P55735 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC13P55735 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC13P55735 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC13P55735 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC13P55735 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC13P55735 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC13P55735 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC13P55735 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC13P55735 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEC13P55735 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC13P55735 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC13P55735 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC13P55735 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC13P55735 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC13P55735 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC13P55735 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC13P55735 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC13P55735 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC13P55735 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC13P55735 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC13P55735 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC13P55735 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC13P55735 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC13P55735 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC13P55735 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC13P55735 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC13P55735 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC13P55735 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC13P55735 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC13P55735 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC13P55735 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC13P55735 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC13P55735 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC13P55735 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC13P55735 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC13P55735 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC13P55735 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC13P55735 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC13P55735 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC13P55735 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC13P55735 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC13P55735 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC13P55735 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC13P55735 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC13P55735 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC13P55735 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC13P55735 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC13P55735 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC13P55735 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms