Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN3P51790 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLCN3P51790 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms