Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
BCAMP50895 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BCAMP50895 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BCAMP50895 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BCAMP50895 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BCAMP50895 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BCAMP50895 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BCAMP50895 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BCAMP50895 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BCAMP50895 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
BCAMP50895 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BCAMP50895 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BCAMP50895 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BCAMP50895 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BCAMP50895 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BCAMP50895 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BCAMP50895 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BCAMP50895 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BCAMP50895 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BCAMP50895 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BCAMP50895 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BCAMP50895 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BCAMP50895 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
BCAMP50895 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BCAMP50895 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BCAMP50895 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BCAMP50895 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BCAMP50895 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BCAMP50895 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BCAMP50895 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BCAMP50895 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BCAMP50895 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BCAMP50895 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BCAMP50895 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BCAMP50895 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BCAMP50895 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
BCAMP50895 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BCAMP50895 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BCAMP50895 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BCAMP50895 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BCAMP50895 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BCAMP50895 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BCAMP50895 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BCAMP50895 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BCAMP50895 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
BCAMP50895 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
BCAMP50895 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BCAMP50895 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BCAMP50895 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BCAMP50895 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BCAMP50895 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BCAMP50895 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BCAMP50895 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BCAMP50895 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BCAMP50895 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
BCAMP50895 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BCAMP50895 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCAMP50895 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCAMP50895 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCAMP50895 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCAMP50895 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCAMP50895 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCAMP50895 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCAMP50895 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCAMP50895 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCAMP50895 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCAMP50895 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
BCAMP50895 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BCAMP50895 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BCAMP50895 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
BCAMP50895 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BCAMP50895 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BCAMP50895 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BCAMP50895 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BCAMP50895 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
BCAMP50895 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BCAMP50895 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BCAMP50895 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BCAMP50895 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCAMP50895 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCAMP50895 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCAMP50895 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCAMP50895 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCAMP50895 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCAMP50895 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCAMP50895 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
BCAMP50895 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCAMP50895 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCAMP50895 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCAMP50895 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BCAMP50895 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BCAMP50895 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BCAMP50895 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BCAMP50895 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BCAMP50895 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BCAMP50895 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
BCAMP50895 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BCAMP50895 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BCAMP50895 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BCAMP50895 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms