Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX1P48742 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX1P48742 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX1P48742 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX1P48742 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX1P48742 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX1P48742 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LHX1P48742 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LHX1P48742 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LHX1P48742 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LHX1P48742 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LHX1P48742 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LHX1P48742 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX1P48742 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX1P48742 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX1P48742 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX1P48742 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX1P48742 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX1P48742 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX1P48742 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LHX1P48742 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LHX1P48742 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LHX1P48742 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LHX1P48742 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX1P48742 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX1P48742 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX1P48742 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX1P48742 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX1P48742 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX1P48742 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LHX1P48742 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LHX1P48742 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LHX1P48742 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX1P48742 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX1P48742 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX1P48742 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX1P48742 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX1P48742 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX1P48742 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX1P48742 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX1P48742 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX1P48742 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX1P48742 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX1P48742 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX1P48742 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX1P48742 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX1P48742 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX1P48742 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX1P48742 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX1P48742 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX1P48742 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX1P48742 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX1P48742 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX1P48742 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX1P48742 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX1P48742 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX1P48742 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX1P48742 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX1P48742 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX1P48742 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX1P48742 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX1P48742 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX1P48742 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX1P48742 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX1P48742 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX1P48742 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX1P48742 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX1P48742 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX1P48742 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX1P48742 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LHX1P48742 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LHX1P48742 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LHX1P48742 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX1P48742 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX1P48742 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX1P48742 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX1P48742 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX1P48742 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX1P48742 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX1P48742 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX1P48742 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX1P48742 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX1P48742 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX1P48742 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX1P48742 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX1P48742 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX1P48742 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX1P48742 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX1P48742 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LHX1P48742 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LHX1P48742 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LHX1P48742 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LHX1P48742 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LHX1P48742 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX1P48742 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX1P48742 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX1P48742 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX1P48742 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX1P48742 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX1P48742 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms