Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RECQLP46063 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RECQLP46063 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RECQLP46063 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RECQLP46063 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RECQLP46063 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RECQLP46063 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RECQLP46063 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RECQLP46063 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RECQLP46063 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RECQLP46063 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RECQLP46063 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RECQLP46063 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RECQLP46063 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RECQLP46063 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RECQLP46063 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RECQLP46063 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RECQLP46063 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RECQLP46063 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RECQLP46063 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RECQLP46063 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RECQLP46063 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RECQLP46063 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RECQLP46063 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RECQLP46063 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RECQLP46063 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RECQLP46063 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RECQLP46063 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RECQLP46063 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RECQLP46063 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RECQLP46063 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RECQLP46063 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RECQLP46063 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RECQLP46063 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RECQLP46063 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RECQLP46063 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RECQLP46063 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RECQLP46063 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RECQLP46063 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RECQLP46063 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RECQLP46063 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RECQLP46063 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RECQLP46063 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RECQLP46063 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RECQLP46063 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RECQLP46063 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RECQLP46063 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RECQLP46063 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RECQLP46063 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RECQLP46063 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RECQLP46063 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RECQLP46063 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RECQLP46063 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RECQLP46063 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RECQLP46063 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RECQLP46063 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RECQLP46063 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RECQLP46063 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RECQLP46063 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RECQLP46063 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RECQLP46063 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RECQLP46063 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RECQLP46063 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RECQLP46063 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RECQLP46063 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RECQLP46063 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RECQLP46063 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RECQLP46063 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RECQLP46063 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RECQLP46063 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RECQLP46063 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RECQLP46063 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RECQLP46063 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RECQLP46063 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RECQLP46063 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RECQLP46063 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RECQLP46063 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RECQLP46063 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RECQLP46063 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RECQLP46063 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RECQLP46063 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RECQLP46063 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RECQLP46063 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RECQLP46063 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RECQLP46063 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RECQLP46063 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RECQLP46063 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RECQLP46063 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RECQLP46063 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RECQLP46063 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RECQLP46063 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RECQLP46063 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RECQLP46063 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RECQLP46063 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RECQLP46063 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RECQLP46063 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RECQLP46063 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RECQLP46063 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RECQLP46063 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RECQLP46063 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms