Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MLH1P40692 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MLH1P40692 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MLH1P40692 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MLH1P40692 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MLH1P40692 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MLH1P40692 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MLH1P40692 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MLH1P40692 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MLH1P40692 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MLH1P40692 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MLH1P40692 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MLH1P40692 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MLH1P40692 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MLH1P40692 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MLH1P40692 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MLH1P40692 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MLH1P40692 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MLH1P40692 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MLH1P40692 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MLH1P40692 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MLH1P40692 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MLH1P40692 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MLH1P40692 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MLH1P40692 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH1P40692 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH1P40692 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH1P40692 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH1P40692 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH1P40692 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH1P40692 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH1P40692 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH1P40692 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH1P40692 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH1P40692 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLH1P40692 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MLH1P40692 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MLH1P40692 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MLH1P40692 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MLH1P40692 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MLH1P40692 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MLH1P40692 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MLH1P40692 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MLH1P40692 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH1P40692 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH1P40692 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH1P40692 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH1P40692 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MLH1P40692 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MLH1P40692 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MLH1P40692 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MLH1P40692 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MLH1P40692 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MLH1P40692 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MLH1P40692 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MLH1P40692 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MLH1P40692 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MLH1P40692 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MLH1P40692 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MLH1P40692 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MLH1P40692 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MLH1P40692 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH1P40692 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH1P40692 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH1P40692 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH1P40692 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLH1P40692 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH1P40692 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH1P40692 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLH1P40692 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MLH1P40692 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MLH1P40692 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH1P40692 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH1P40692 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH1P40692 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLH1P40692 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MLH1P40692 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MLH1P40692 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MLH1P40692 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MLH1P40692 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MLH1P40692 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MLH1P40692 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MLH1P40692 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MLH1P40692 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MLH1P40692 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MLH1P40692 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MLH1P40692 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MLH1P40692 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MLH1P40692 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MLH1P40692 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MLH1P40692 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH1P40692 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH1P40692 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH1P40692 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH1P40692 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH1P40692 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLH1P40692 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH1P40692 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH1P40692 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH1P40692 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms