Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCKARP32238 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCKARP32238 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCKARP32238 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCKARP32238 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCKARP32238 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCKARP32238 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCKARP32238 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCKARP32238 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCKARP32238 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCKARP32238 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCKARP32238 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCKARP32238 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCKARP32238 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCKARP32238 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCKARP32238 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCKARP32238 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCKARP32238 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCKARP32238 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCKARP32238 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCKARP32238 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCKARP32238 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKARP32238 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKARP32238 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKARP32238 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKARP32238 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKARP32238 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKARP32238 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCKARP32238 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCKARP32238 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCKARP32238 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCKARP32238 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCKARP32238 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCKARP32238 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCKARP32238 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKARP32238 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKARP32238 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKARP32238 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKARP32238 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCKARP32238 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCKARP32238 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCKARP32238 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCKARP32238 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCKARP32238 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCKARP32238 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCKARP32238 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCKARP32238 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCKARP32238 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCKARP32238 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCKARP32238 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCKARP32238 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCKARP32238 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCKARP32238 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCKARP32238 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCKARP32238 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCKARP32238 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCKARP32238 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCKARP32238 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCKARP32238 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCKARP32238 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCKARP32238 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCKARP32238 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCKARP32238 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCKARP32238 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCKARP32238 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCKARP32238 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCKARP32238 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCKARP32238 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCKARP32238 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCKARP32238 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCKARP32238 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCKARP32238 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCKARP32238 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCKARP32238 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCKARP32238 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCKARP32238 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCKARP32238 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCKARP32238 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCKARP32238 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCKARP32238 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCKARP32238 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCKARP32238 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCKARP32238 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCKARP32238 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCKARP32238 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKARP32238 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKARP32238 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKARP32238 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKARP32238 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKARP32238 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKARP32238 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKARP32238 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKARP32238 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKARP32238 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKARP32238 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKARP32238 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKARP32238 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKARP32238 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCKARP32238 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCKARP32238 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms