Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFS1P28331 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFS1P28331 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms