Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HTR1BP28222 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms