Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
HRCP23327 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
HRCP23327 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
HRCP23327 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
HRCP23327 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
HRCP23327 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
HRCP23327 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
HRCP23327 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
HRCP23327 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
HRCP23327 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
HRCP23327 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
HRCP23327 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
HRCP23327 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
HRCP23327 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
HRCP23327 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
HRCP23327 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
HRCP23327 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
HRCP23327 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
HRCP23327 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
HRCP23327 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
HRCP23327 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
HRCP23327 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
HRCP23327 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
HRCP23327 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
HRCP23327 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
HRCP23327 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
HRCP23327 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
HRCP23327 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
HRCP23327 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
HRCP23327 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
HRCP23327 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
HRCP23327 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
HRCP23327 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
HRCP23327 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
HRCP23327 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
HRCP23327 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
HRCP23327 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
HRCP23327 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
HRCP23327 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
HRCP23327 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
HRCP23327 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
HRCP23327 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
HRCP23327 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
HRCP23327 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
HRCP23327 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
HRCP23327 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
HRCP23327 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
HRCP23327 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
HRCP23327 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
HRCP23327 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
HRCP23327 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
HRCP23327 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
HRCP23327 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
HRCP23327 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
HRCP23327 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
HRCP23327 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
HRCP23327 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
HRCP23327 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
HRCP23327 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
HRCP23327 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
HRCP23327 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
HRCP23327 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
HRCP23327 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
HRCP23327 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
HRCP23327 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
HRCP23327 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
HRCP23327 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
HRCP23327 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
HRCP23327 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
HRCP23327 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
HRCP23327 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
HRCP23327 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
HRCP23327 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
HRCP23327 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
HRCP23327 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
HRCP23327 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
HRCP23327 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
HRCP23327 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
HRCP23327 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
HRCP23327 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
HRCP23327 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
HRCP23327 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
HRCP23327 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
HRCP23327 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
HRCP23327 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
HRCP23327 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
HRCP23327 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
HRCP23327 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
HRCP23327 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
HRCP23327 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
HRCP23327 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
HRCP23327 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
HRCP23327 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
HRCP23327 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
HRCP23327 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
HRCP23327 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
HRCP23327 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
HRCP23327 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
HRCP23327 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
HRCP23327 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms