Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FLT1P17948 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FLT1P17948 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FLT1P17948 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FLT1P17948 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FLT1P17948 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FLT1P17948 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FLT1P17948 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FLT1P17948 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FLT1P17948 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FLT1P17948 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FLT1P17948 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FLT1P17948 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FLT1P17948 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FLT1P17948 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FLT1P17948 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FLT1P17948 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FLT1P17948 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FLT1P17948 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FLT1P17948 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FLT1P17948 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FLT1P17948 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FLT1P17948 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FLT1P17948 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FLT1P17948 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FLT1P17948 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
FLT1P17948 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
FLT1P17948 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FLT1P17948 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FLT1P17948 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FLT1P17948 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FLT1P17948 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FLT1P17948 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FLT1P17948 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FLT1P17948 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FLT1P17948 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FLT1P17948 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FLT1P17948 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FLT1P17948 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FLT1P17948 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FLT1P17948 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FLT1P17948 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FLT1P17948 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FLT1P17948 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FLT1P17948 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FLT1P17948 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FLT1P17948 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FLT1P17948 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FLT1P17948 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FLT1P17948 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FLT1P17948 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FLT1P17948 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FLT1P17948 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FLT1P17948 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FLT1P17948 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FLT1P17948 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FLT1P17948 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FLT1P17948 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
FLT1P17948 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FLT1P17948 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FLT1P17948 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FLT1P17948 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FLT1P17948 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FLT1P17948 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FLT1P17948 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FLT1P17948 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FLT1P17948 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FLT1P17948 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FLT1P17948 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FLT1P17948 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FLT1P17948 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FLT1P17948 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FLT1P17948 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FLT1P17948 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FLT1P17948 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FLT1P17948 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FLT1P17948 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FLT1P17948 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FLT1P17948 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FLT1P17948 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FLT1P17948 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FLT1P17948 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FLT1P17948 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FLT1P17948 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FLT1P17948 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FLT1P17948 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FLT1P17948 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FLT1P17948 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FLT1P17948 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FLT1P17948 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FLT1P17948 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FLT1P17948 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FLT1P17948 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FLT1P17948 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FLT1P17948 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FLT1P17948 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FLT1P17948 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FLT1P17948 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FLT1P17948 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FLT1P17948 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms