Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
UBTFP17480 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
UBTFP17480 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
UBTFP17480 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
UBTFP17480 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
UBTFP17480 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
UBTFP17480 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
UBTFP17480 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
UBTFP17480 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
UBTFP17480 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
UBTFP17480 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
UBTFP17480 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
UBTFP17480 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
UBTFP17480 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
UBTFP17480 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
UBTFP17480 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
UBTFP17480 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
UBTFP17480 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
UBTFP17480 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
UBTFP17480 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
UBTFP17480 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
UBTFP17480 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
UBTFP17480 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
UBTFP17480 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
UBTFP17480 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
UBTFP17480 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
UBTFP17480 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
UBTFP17480 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
UBTFP17480 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
UBTFP17480 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
UBTFP17480 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
UBTFP17480 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
UBTFP17480 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
UBTFP17480 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
UBTFP17480 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
UBTFP17480 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
UBTFP17480 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
UBTFP17480 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
UBTFP17480 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
UBTFP17480 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
UBTFP17480 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
UBTFP17480 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
UBTFP17480 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
UBTFP17480 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
UBTFP17480 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
UBTFP17480 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
UBTFP17480 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
UBTFP17480 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
UBTFP17480 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
UBTFP17480 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
UBTFP17480 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
UBTFP17480 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
UBTFP17480 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
UBTFP17480 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
UBTFP17480 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
UBTFP17480 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
UBTFP17480 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
UBTFP17480 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
UBTFP17480 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
UBTFP17480 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
UBTFP17480 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
UBTFP17480 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
UBTFP17480 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
UBTFP17480 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
UBTFP17480 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
UBTFP17480 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
UBTFP17480 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
UBTFP17480 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
UBTFP17480 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
UBTFP17480 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
UBTFP17480 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
UBTFP17480 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
UBTFP17480 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
UBTFP17480 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
UBTFP17480 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
UBTFP17480 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
UBTFP17480 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
UBTFP17480 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
UBTFP17480 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
UBTFP17480 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
UBTFP17480 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
UBTFP17480 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
UBTFP17480 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
UBTFP17480 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
UBTFP17480 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
UBTFP17480 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
UBTFP17480 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
UBTFP17480 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
UBTFP17480 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
UBTFP17480 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
UBTFP17480 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
UBTFP17480 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
UBTFP17480 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
UBTFP17480 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
UBTFP17480 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
UBTFP17480 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
UBTFP17480 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
UBTFP17480 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
UBTFP17480 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
UBTFP17480 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms