Protein–RNA interactions for Protein: P16035

TIMP2, Metalloproteinase inhibitor 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP2P16035 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMP2P16035 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIMP2P16035 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMP2P16035 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMP2P16035 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMP2P16035 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMP2P16035 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIMP2P16035 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMP2P16035 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TIMP2P16035 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMP2P16035 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms